Deux protocoles de surveillance complémentaires standardisés à l'échelle de l'unité fonctionnelle (définie pour les oiseaux limicoles côtiers) sont actuellement développés et étendues sur 68 localités du littoral :
- comptages mensuels aux dates des IWC (International Waderbird Census), cette méthode consiste a enregistrer les principaux paramètres qualitatifs et quantitatifs caractérisant le stationnement des oiseaux limicoles côtiers ;
- surveillance continue des habitats benthiques intertidaux, elles s'appuie sur des campagnes d'échantillonnage reconduite chaque années vers le 15/10. ce protocole doit permettre l'enregistrement par localité estuarienne ou côtière suivie, les principales caractéristiques des communautés benthiques et des faciès associés (approche biomorphosédimentaire, taxonomique,densitaire et biométrique) et d'en mesurer leur évolution dans le temps et l'espace.
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